Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnn1Q08091 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnn1Q08091 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.2 ms