Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AmbpQ07456 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms