Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntn3Q07409 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntn3Q07409 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntn3Q07409 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntn3Q07409 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntn3Q07409 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntn3Q07409 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntn3Q07409 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntn3Q07409 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntn3Q07409 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn3Q07409 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn3Q07409 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn3Q07409 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn3Q07409 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn3Q07409 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntn3Q07409 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntn3Q07409 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntn3Q07409 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntn3Q07409 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntn3Q07409 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntn3Q07409 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms