Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3bp2Q06649 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3bp2Q06649 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3bp2Q06649 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3bp2Q06649 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3bp2Q06649 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp2Q06649 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sh3bp2Q06649 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp2Q06649 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp2Q06649 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp2Q06649 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bp2Q06649 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bp2Q06649 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bp2Q06649 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp2Q06649 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms