Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cab39Q06138 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms