Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r236Q05A06 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 333.1 ms