Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk18Q04899 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms