Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sox10Q04888 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sox10Q04888 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sox10Q04888 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sox10Q04888 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox10Q04888 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox10Q04888 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox10Q04888 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox10Q04888 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox10Q04888 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox10Q04888 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox10Q04888 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox10Q04888 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox10Q04888 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox10Q04888 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sox10Q04888 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sox10Q04888 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sox10Q04888 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sox10Q04888 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sox10Q04888 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sox10Q04888 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sox10Q04888 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sox10Q04888 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox10Q04888 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox10Q04888 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox10Q04888 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox10Q04888 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox10Q04888 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox10Q04888 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox10Q04888 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sox10Q04888 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sox10Q04888 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sox10Q04888 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sox10Q04888 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Sox10Q04888 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sox10Q04888 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms