Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RelbQ04863 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RelbQ04863 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RelbQ04863 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RelbQ04863 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RelbQ04863 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RelbQ04863 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RelbQ04863 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RelbQ04863 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms