Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col6a1Q04857 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col6a1Q04857 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col6a1Q04857 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col6a1Q04857 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col6a1Q04857 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col6a1Q04857 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col6a1Q04857 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col6a1Q04857 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col6a1Q04857 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col6a1Q04857 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col6a1Q04857 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col6a1Q04857 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col6a1Q04857 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col6a1Q04857 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col6a1Q04857 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col6a1Q04857 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col6a1Q04857 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col6a1Q04857 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col6a1Q04857 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col6a1Q04857 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col6a1Q04857 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col6a1Q04857 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Col6a1Q04857 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Col6a1Q04857 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Col6a1Q04857 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col6a1Q04857 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col6a1Q04857 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col6a1Q04857 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col6a1Q04857 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col6a1Q04857 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col6a1Q04857 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col6a1Q04857 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col6a1Q04857 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col6a1Q04857 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col6a1Q04857 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Col6a1Q04857 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col6a1Q04857 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col6a1Q04857 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col6a1Q04857 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col6a1Q04857 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col6a1Q04857 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col6a1Q04857 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col6a1Q04857 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col6a1Q04857 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col6a1Q04857 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col6a1Q04857 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col6a1Q04857 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col6a1Q04857 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col6a1Q04857 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col6a1Q04857 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col6a1Q04857 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Col6a1Q04857 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col6a1Q04857 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col6a1Q04857 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col6a1Q04857 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col6a1Q04857 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col6a1Q04857 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col6a1Q04857 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col6a1Q04857 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col6a1Q04857 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col6a1Q04857 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col6a1Q04857 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col6a1Q04857 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col6a1Q04857 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col6a1Q04857 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Col6a1Q04857 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col6a1Q04857 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col6a1Q04857 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Col6a1Q04857 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col6a1Q04857 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col6a1Q04857 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col6a1Q04857 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col6a1Q04857 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col6a1Q04857 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col6a1Q04857 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col6a1Q04857 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col6a1Q04857 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col6a1Q04857 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col6a1Q04857 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col6a1Q04857 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col6a1Q04857 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col6a1Q04857 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col6a1Q04857 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Col6a1Q04857 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col6a1Q04857 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col6a1Q04857 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col6a1Q04857 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Col6a1Q04857 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col6a1Q04857 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col6a1Q04857 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col6a1Q04857 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col6a1Q04857 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col6a1Q04857 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col6a1Q04857 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col6a1Q04857 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col6a1Q04857 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col6a1Q04857 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Col6a1Q04857 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col6a1Q04857 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms