Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smpd1Q04519 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Smpd1Q04519 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smpd1Q04519 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Smpd1Q04519 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smpd1Q04519 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smpd1Q04519 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smpd1Q04519 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Smpd1Q04519 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms