Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kcnb1Q03717 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnb1Q03717 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnb1Q03717 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnb1Q03717 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnb1Q03717 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnb1Q03717 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnb1Q03717 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnb1Q03717 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnb1Q03717 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnb1Q03717 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnb1Q03717 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnb1Q03717 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnb1Q03717 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnb1Q03717 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnb1Q03717 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnb1Q03717 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnb1Q03717 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnb1Q03717 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnb1Q03717 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnb1Q03717 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnb1Q03717 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnb1Q03717 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnb1Q03717 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnb1Q03717 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnb1Q03717 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnb1Q03717 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnb1Q03717 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnb1Q03717 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnb1Q03717 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnb1Q03717 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnb1Q03717 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnb1Q03717 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Kcnb1Q03717 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnb1Q03717 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnb1Q03717 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnb1Q03717 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnb1Q03717 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnb1Q03717 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnb1Q03717 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnb1Q03717 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnb1Q03717 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnb1Q03717 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnb1Q03717 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnb1Q03717 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnb1Q03717 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnb1Q03717 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnb1Q03717 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnb1Q03717 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnb1Q03717 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnb1Q03717 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnb1Q03717 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnb1Q03717 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnb1Q03717 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnb1Q03717 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnb1Q03717 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnb1Q03717 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnb1Q03717 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnb1Q03717 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnb1Q03717 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnb1Q03717 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnb1Q03717 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnb1Q03717 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnb1Q03717 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnb1Q03717 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnb1Q03717 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnb1Q03717 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms