Protein–RNA interactions for Protein: Q03147

Cdk7, Cyclin-dependent kinase 7, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk7Q03147 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk7Q03147 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cdk7Q03147 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk7Q03147 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk7Q03147 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk7Q03147 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk7Q03147 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk7Q03147 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk7Q03147 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk7Q03147 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk7Q03147 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk7Q03147 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk7Q03147 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk7Q03147 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk7Q03147 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk7Q03147 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk7Q03147 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk7Q03147 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk7Q03147 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk7Q03147 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk7Q03147 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk7Q03147 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk7Q03147 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk7Q03147 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk7Q03147 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk7Q03147 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk7Q03147 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk7Q03147 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk7Q03147 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk7Q03147 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk7Q03147 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk7Q03147 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk7Q03147 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk7Q03147 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk7Q03147 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk7Q03147 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms