Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax5Q02650 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax5Q02650 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms