Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GscQ02591 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GscQ02591 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GscQ02591 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GscQ02591 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GscQ02591 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GscQ02591 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GscQ02591 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GscQ02591 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GscQ02591 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GscQ02591 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GscQ02591 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GscQ02591 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GscQ02591 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GscQ02591 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GscQ02591 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GscQ02591 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GscQ02591 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GscQ02591 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GscQ02591 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GscQ02591 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GscQ02591 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GscQ02591 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GscQ02591 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GscQ02591 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GscQ02591 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GscQ02591 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GscQ02591 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GscQ02591 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GscQ02591 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GscQ02591 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GscQ02591 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GscQ02591 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GscQ02591 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GscQ02591 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GscQ02591 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GscQ02591 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GscQ02591 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GscQ02591 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GscQ02591 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GscQ02591 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GscQ02591 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GscQ02591 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GscQ02591 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GscQ02591 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GscQ02591 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GscQ02591 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GscQ02591 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GscQ02591 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GscQ02591 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GscQ02591 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GscQ02591 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GscQ02591 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GscQ02591 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GscQ02591 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GscQ02591 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GscQ02591 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GscQ02591 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GscQ02591 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GscQ02591 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GscQ02591 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GscQ02591 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GscQ02591 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GscQ02591 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GscQ02591 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GscQ02591 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GscQ02591 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GscQ02591 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GscQ02591 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GscQ02591 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GscQ02591 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GscQ02591 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GscQ02591 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GscQ02591 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GscQ02591 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GscQ02591 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GscQ02591 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GscQ02591 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GscQ02591 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GscQ02591 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GscQ02591 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GscQ02591 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GscQ02591 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GscQ02591 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GscQ02591 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GscQ02591 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GscQ02591 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GscQ02591 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GscQ02591 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GscQ02591 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GscQ02591 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GscQ02591 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GscQ02591 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GscQ02591 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GscQ02591 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GscQ02591 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GscQ02591 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GscQ02591 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GscQ02591 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GscQ02591 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms