Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ly9Q01965 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ly9Q01965 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ly9Q01965 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ly9Q01965 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ly9Q01965 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ly9Q01965 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ly9Q01965 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ly9Q01965 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ly9Q01965 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ly9Q01965 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ly9Q01965 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ly9Q01965 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ly9Q01965 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ly9Q01965 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ly9Q01965 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ly9Q01965 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ly9Q01965 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ly9Q01965 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ly9Q01965 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ly9Q01965 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ly9Q01965 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ly9Q01965 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ly9Q01965 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ly9Q01965 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ly9Q01965 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ly9Q01965 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ly9Q01965 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ly9Q01965 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ly9Q01965 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ly9Q01965 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ly9Q01965 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ly9Q01965 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ly9Q01965 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ly9Q01965 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ly9Q01965 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ly9Q01965 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ly9Q01965 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ly9Q01965 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ly9Q01965 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ly9Q01965 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ly9Q01965 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ly9Q01965 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ly9Q01965 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ly9Q01965 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ly9Q01965 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ly9Q01965 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ly9Q01965 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ly9Q01965 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ly9Q01965 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ly9Q01965 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ly9Q01965 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ly9Q01965 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ly9Q01965 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ly9Q01965 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ly9Q01965 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ly9Q01965 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ly9Q01965 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ly9Q01965 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ly9Q01965 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ly9Q01965 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ly9Q01965 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ly9Q01965 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ly9Q01965 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ly9Q01965 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ly9Q01965 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ly9Q01965 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ly9Q01965 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms