Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbp1Q01514 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp1Q01514 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 587.4 ms