Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sec23aQ01405 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Sec23aQ01405 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sec23aQ01405 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sec23aQ01405 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sec23aQ01405 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sec23aQ01405 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sec23aQ01405 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sec23aQ01405 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sec23aQ01405 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sec23aQ01405 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sec23aQ01405 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sec23aQ01405 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sec23aQ01405 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sec23aQ01405 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sec23aQ01405 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Sec23aQ01405 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sec23aQ01405 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms