Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Top2aQ01320 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Top2aQ01320 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Top2aQ01320 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Top2aQ01320 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Top2aQ01320 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Top2aQ01320 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Top2aQ01320 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Top2aQ01320 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Top2aQ01320 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Top2aQ01320 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Top2aQ01320 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Top2aQ01320 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Top2aQ01320 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Top2aQ01320 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Top2aQ01320 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Top2aQ01320 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Top2aQ01320 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Top2aQ01320 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Top2aQ01320 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
Top2aQ01320 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Top2aQ01320 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Top2aQ01320 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Top2aQ01320 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Top2aQ01320 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Top2aQ01320 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Top2aQ01320 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Top2aQ01320 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Top2aQ01320 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Top2aQ01320 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Top2aQ01320 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Top2aQ01320 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Top2aQ01320 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Top2aQ01320 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Top2aQ01320 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Top2aQ01320 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Top2aQ01320 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Top2aQ01320 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Top2aQ01320 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Top2aQ01320 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Top2aQ01320 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Top2aQ01320 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Top2aQ01320 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Top2aQ01320 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Top2aQ01320 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Top2aQ01320 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Top2aQ01320 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Top2aQ01320 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Top2aQ01320 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Top2aQ01320 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
Top2aQ01320 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
Top2aQ01320 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Top2aQ01320 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Top2aQ01320 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Top2aQ01320 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Top2aQ01320 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Top2aQ01320 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Top2aQ01320 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Top2aQ01320 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Top2aQ01320 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Top2aQ01320 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Top2aQ01320 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Top2aQ01320 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Top2aQ01320 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Top2aQ01320 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Top2aQ01320 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Top2aQ01320 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Top2aQ01320 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Top2aQ01320 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Top2aQ01320 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Top2aQ01320 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Top2aQ01320 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Top2aQ01320 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Top2aQ01320 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Top2aQ01320 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Top2aQ01320 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Top2aQ01320 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
Top2aQ01320 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Top2aQ01320 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Top2aQ01320 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Top2aQ01320 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Top2aQ01320 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Top2aQ01320 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Top2aQ01320 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Top2aQ01320 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Top2aQ01320 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Top2aQ01320 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Top2aQ01320 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Top2aQ01320 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Top2aQ01320 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Top2aQ01320 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Top2aQ01320 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Top2aQ01320 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Top2aQ01320 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Top2aQ01320 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Top2aQ01320 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Top2aQ01320 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Top2aQ01320 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Top2aQ01320 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Top2aQ01320 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms