Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EgfrQ01279 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
EgfrQ01279 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EgfrQ01279 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EgfrQ01279 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EgfrQ01279 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EgfrQ01279 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EgfrQ01279 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EgfrQ01279 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EgfrQ01279 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EgfrQ01279 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EgfrQ01279 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EgfrQ01279 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EgfrQ01279 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EgfrQ01279 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EgfrQ01279 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EgfrQ01279 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EgfrQ01279 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EgfrQ01279 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EgfrQ01279 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EgfrQ01279 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EgfrQ01279 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EgfrQ01279 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EgfrQ01279 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EgfrQ01279 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EgfrQ01279 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EgfrQ01279 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EgfrQ01279 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EgfrQ01279 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EgfrQ01279 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EgfrQ01279 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
EgfrQ01279 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EgfrQ01279 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EgfrQ01279 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EgfrQ01279 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EgfrQ01279 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EgfrQ01279 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EgfrQ01279 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EgfrQ01279 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EgfrQ01279 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EgfrQ01279 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EgfrQ01279 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EgfrQ01279 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EgfrQ01279 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EgfrQ01279 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EgfrQ01279 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EgfrQ01279 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EgfrQ01279 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
EgfrQ01279 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EgfrQ01279 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EgfrQ01279 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EgfrQ01279 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EgfrQ01279 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EgfrQ01279 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EgfrQ01279 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
EgfrQ01279 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EgfrQ01279 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EgfrQ01279 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EgfrQ01279 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EgfrQ01279 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EgfrQ01279 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EgfrQ01279 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EgfrQ01279 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
EgfrQ01279 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EgfrQ01279 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EgfrQ01279 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
EgfrQ01279 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EgfrQ01279 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EgfrQ01279 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
EgfrQ01279 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EgfrQ01279 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EgfrQ01279 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EgfrQ01279 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EgfrQ01279 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EgfrQ01279 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EgfrQ01279 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EgfrQ01279 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EgfrQ01279 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EgfrQ01279 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EgfrQ01279 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EgfrQ01279 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EgfrQ01279 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EgfrQ01279 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EgfrQ01279 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EgfrQ01279 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EgfrQ01279 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EgfrQ01279 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EgfrQ01279 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EgfrQ01279 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EgfrQ01279 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EgfrQ01279 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EgfrQ01279 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EgfrQ01279 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EgfrQ01279 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EgfrQ01279 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EgfrQ01279 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EgfrQ01279 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EgfrQ01279 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EgfrQ01279 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EgfrQ01279 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms