Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HmgcrQ01237 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HmgcrQ01237 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HmgcrQ01237 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HmgcrQ01237 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HmgcrQ01237 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HmgcrQ01237 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HmgcrQ01237 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HmgcrQ01237 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HmgcrQ01237 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HmgcrQ01237 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HmgcrQ01237 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
HmgcrQ01237 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HmgcrQ01237 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HmgcrQ01237 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HmgcrQ01237 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HmgcrQ01237 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HmgcrQ01237 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HmgcrQ01237 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HmgcrQ01237 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HmgcrQ01237 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HmgcrQ01237 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HmgcrQ01237 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HmgcrQ01237 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HmgcrQ01237 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HmgcrQ01237 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HmgcrQ01237 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HmgcrQ01237 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HmgcrQ01237 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HmgcrQ01237 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HmgcrQ01237 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HmgcrQ01237 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HmgcrQ01237 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HmgcrQ01237 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HmgcrQ01237 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HmgcrQ01237 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HmgcrQ01237 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HmgcrQ01237 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HmgcrQ01237 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HmgcrQ01237 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HmgcrQ01237 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HmgcrQ01237 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HmgcrQ01237 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HmgcrQ01237 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HmgcrQ01237 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HmgcrQ01237 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HmgcrQ01237 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HmgcrQ01237 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HmgcrQ01237 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HmgcrQ01237 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HmgcrQ01237 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HmgcrQ01237 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HmgcrQ01237 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HmgcrQ01237 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HmgcrQ01237 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HmgcrQ01237 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HmgcrQ01237 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms