Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gjb2Q00977 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gjb2Q00977 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gjb2Q00977 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gjb2Q00977 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gjb2Q00977 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gjb2Q00977 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gjb2Q00977 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gjb2Q00977 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gjb2Q00977 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gjb2Q00977 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gjb2Q00977 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gjb2Q00977 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gjb2Q00977 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gjb2Q00977 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gjb2Q00977 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gjb2Q00977 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gjb2Q00977 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gjb2Q00977 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms