Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SeleQ00690 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SeleQ00690 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SeleQ00690 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SeleQ00690 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms