Protein–RNA interactions for Protein: Q00609

Cd80, T-lymphocyte activation antigen CD80, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd80Q00609 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd80Q00609 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd80Q00609 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cd80Q00609 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd80Q00609 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd80Q00609 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd80Q00609 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cd80Q00609 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cd80Q00609 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd80Q00609 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cd80Q00609 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd80Q00609 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd80Q00609 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd80Q00609 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cd80Q00609 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms