Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GabpaQ00422 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GabpaQ00422 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GabpaQ00422 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GabpaQ00422 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GabpaQ00422 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GabpaQ00422 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GabpaQ00422 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GabpaQ00422 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GabpaQ00422 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GabpaQ00422 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GabpaQ00422 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GabpaQ00422 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GabpaQ00422 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GabpaQ00422 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GabpaQ00422 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GabpaQ00422 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GabpaQ00422 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GabpaQ00422 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GabpaQ00422 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GabpaQ00422 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GabpaQ00422 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GabpaQ00422 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GabpaQ00422 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GabpaQ00422 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GabpaQ00422 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GabpaQ00422 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GabpaQ00422 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms