Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax8Q00288 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms