Protein–RNA interactions for Protein: P98197

Atp11a, Probable phospholipid-transporting ATPase IH, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11aP98197 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp11aP98197 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp11aP98197 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp11aP98197 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp11aP98197 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp11aP98197 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atp11aP98197 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atp11aP98197 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp11aP98197 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp11aP98197 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp11aP98197 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp11aP98197 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp11aP98197 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp11aP98197 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp11aP98197 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp11aP98197 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp11aP98197 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp11aP98197 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp11aP98197 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp11aP98197 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp11aP98197 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp11aP98197 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp11aP98197 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp11aP98197 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp11aP98197 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp11aP98197 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp11aP98197 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp11aP98197 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp11aP98197 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp11aP98197 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp11aP98197 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp11aP98197 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp11aP98197 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp11aP98197 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp11aP98197 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp11aP98197 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp11aP98197 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp11aP98197 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp11aP98197 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms