Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cry1P97784 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cry1P97784 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cry1P97784 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cry1P97784 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cry1P97784 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cry1P97784 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cry1P97784 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cry1P97784 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cry1P97784 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cry1P97784 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cry1P97784 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cry1P97784 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cry1P97784 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cry1P97784 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cry1P97784 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cry1P97784 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cry1P97784 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cry1P97784 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cry1P97784 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cry1P97784 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cry1P97784 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cry1P97784 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cry1P97784 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cry1P97784 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cry1P97784 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cry1P97784 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cry1P97784 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cry1P97784 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cry1P97784 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cry1P97784 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cry1P97784 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cry1P97784 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cry1P97784 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cry1P97784 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cry1P97784 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cry1P97784 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cry1P97784 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cry1P97784 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cry1P97784 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cry1P97784 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cry1P97784 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cry1P97784 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cry1P97784 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cry1P97784 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cry1P97784 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cry1P97784 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cry1P97784 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cry1P97784 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cry1P97784 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cry1P97784 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cry1P97784 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cry1P97784 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cry1P97784 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cry1P97784 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cry1P97784 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cry1P97784 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms