Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lig3P97386 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lig3P97386 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lig3P97386 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lig3P97386 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms