Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SmsP97355 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SmsP97355 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SmsP97355 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SmsP97355 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SmsP97355 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SmsP97355 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SmsP97355 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SmsP97355 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SmsP97355 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SmsP97355 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SmsP97355 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SmsP97355 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SmsP97355 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SmsP97355 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SmsP97355 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SmsP97355 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SmsP97355 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SmsP97355 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SmsP97355 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SmsP97355 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SmsP97355 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SmsP97355 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SmsP97355 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SmsP97355 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SmsP97355 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SmsP97355 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SmsP97355 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SmsP97355 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SmsP97355 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SmsP97355 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SmsP97355 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SmsP97355 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SmsP97355 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SmsP97355 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SmsP97355 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SmsP97355 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SmsP97355 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SmsP97355 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SmsP97355 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SmsP97355 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SmsP97355 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SmsP97355 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SmsP97355 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SmsP97355 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SmsP97355 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SmsP97355 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SmsP97355 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SmsP97355 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SmsP97355 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SmsP97355 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SmsP97355 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SmsP97355 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SmsP97355 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SmsP97355 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SmsP97355 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SmsP97355 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SmsP97355 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SmsP97355 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SmsP97355 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SmsP97355 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SmsP97355 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SmsP97355 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SmsP97355 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SmsP97355 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SmsP97355 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SmsP97355 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SmsP97355 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SmsP97355 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SmsP97355 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SmsP97355 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SmsP97355 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SmsP97355 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SmsP97355 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SmsP97355 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SmsP97355 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SmsP97355 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SmsP97355 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SmsP97355 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SmsP97355 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SmsP97355 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SmsP97355 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SmsP97355 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SmsP97355 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SmsP97355 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SmsP97355 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SmsP97355 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SmsP97355 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SmsP97355 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SmsP97355 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SmsP97355 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SmsP97355 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SmsP97355 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SmsP97355 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SmsP97355 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SmsP97355 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SmsP97355 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SmsP97355 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SmsP97355 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SmsP97355 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms