Protein–RNA interactions for Protein: P97353

Sec1, Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec1P97353 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec1P97353 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec1P97353 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec1P97353 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec1P97353 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec1P97353 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec1P97353 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec1P97353 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec1P97353 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec1P97353 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec1P97353 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec1P97353 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec1P97353 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec1P97353 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec1P97353 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec1P97353 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec1P97353 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec1P97353 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec1P97353 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec1P97353 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec1P97353 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec1P97353 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec1P97353 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec1P97353 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec1P97353 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec1P97353 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec1P97353 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec1P97353 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec1P97353 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec1P97353 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec1P97353 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec1P97353 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec1P97353 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec1P97353 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec1P97353 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec1P97353 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec1P97353 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec1P97353 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sec1P97353 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec1P97353 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec1P97353 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec1P97353 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec1P97353 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec1P97353 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec1P97353 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sec1P97353 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec1P97353 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec1P97353 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec1P97353 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms