Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nkx2-3P97334 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nkx2-3P97334 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nkx2-3P97334 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Nkx2-3P97334 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nkx2-3P97334 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nkx2-3P97334 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nkx2-3P97334 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Nkx2-3P97334 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nkx2-3P97334 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nkx2-3P97334 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nkx2-3P97334 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nkx2-3P97334 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nkx2-3P97334 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nkx2-3P97334 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nkx2-3P97334 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nkx2-3P97334 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nkx2-3P97334 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nkx2-3P97334 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nkx2-3P97334 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nkx2-3P97334 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nkx2-3P97334 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nkx2-3P97334 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nkx2-3P97334 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nkx2-3P97334 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nkx2-3P97334 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nkx2-3P97334 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nkx2-3P97334 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nkx2-3P97334 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nkx2-3P97334 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nkx2-3P97334 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nkx2-3P97334 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nkx2-3P97334 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nkx2-3P97334 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nkx2-3P97334 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nkx2-3P97334 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nkx2-3P97334 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nkx2-3P97334 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nkx2-3P97334 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nkx2-3P97334 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nkx2-3P97334 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nkx2-3P97334 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nkx2-3P97334 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nkx2-3P97334 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nkx2-3P97334 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nkx2-3P97334 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Nkx2-3P97334 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nkx2-3P97334 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Nkx2-3P97334 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms