Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arf1P84078 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arf1P84078 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arf1P84078 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arf1P84078 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arf1P84078 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Arf1P84078 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Arf1P84078 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arf1P84078 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arf1P84078 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arf1P84078 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arf1P84078 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arf1P84078 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arf1P84078 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arf1P84078 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arf1P84078 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arf1P84078 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arf1P84078 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arf1P84078 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arf1P84078 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arf1P84078 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arf1P84078 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Arf1P84078 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arf1P84078 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Arf1P84078 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arf1P84078 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arf1P84078 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arf1P84078 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arf1P84078 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arf1P84078 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arf1P84078 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arf1P84078 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arf1P84078 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arf1P84078 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arf1P84078 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arf1P84078 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arf1P84078 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Arf1P84078 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Arf1P84078 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Arf1P84078 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Arf1P84078 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms