Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gabpb2P81069 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gabpb2P81069 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gabpb2P81069 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gabpb2P81069 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gabpb2P81069 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gabpb2P81069 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gabpb2P81069 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gabpb2P81069 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gabpb2P81069 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gabpb2P81069 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gabpb2P81069 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gabpb2P81069 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gabpb2P81069 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gabpb2P81069 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gabpb2P81069 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Gabpb2P81069 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gabpb2P81069 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gabpb2P81069 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms