Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Otx2P80206 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Otx2P80206 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Otx2P80206 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Otx2P80206 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Otx2P80206 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Otx2P80206 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Otx2P80206 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Otx2P80206 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Otx2P80206 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Otx2P80206 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Otx2P80206 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Otx2P80206 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Otx2P80206 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Otx2P80206 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Otx2P80206 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Otx2P80206 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Otx2P80206 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Otx2P80206 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Otx2P80206 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Otx2P80206 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Otx2P80206 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Otx2P80206 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Otx2P80206 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Otx2P80206 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Otx2P80206 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Otx2P80206 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Otx2P80206 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Otx2P80206 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Otx2P80206 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Otx2P80206 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Otx2P80206 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Otx2P80206 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Otx2P80206 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Otx2P80206 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Otx2P80206 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Otx2P80206 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Otx2P80206 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Otx2P80206 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Otx2P80206 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Otx2P80206 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Otx2P80206 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Otx2P80206 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Otx2P80206 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Otx2P80206 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Otx2P80206 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Otx2P80206 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Otx2P80206 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Otx2P80206 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Otx2P80206 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Otx2P80206 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Otx2P80206 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Otx2P80206 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Otx2P80206 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Otx2P80206 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Otx2P80206 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Otx2P80206 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Otx2P80206 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Otx2P80206 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Otx2P80206 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Otx2P80206 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Otx2P80206 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Otx2P80206 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Otx2P80206 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Otx2P80206 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms