Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sparcl1P70663 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Sparcl1P70663 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms