Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msx3P70354 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Msx3P70354 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Msx3P70354 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Msx3P70354 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Msx3P70354 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Msx3P70354 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Msx3P70354 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Msx3P70354 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Msx3P70354 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Msx3P70354 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Msx3P70354 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Msx3P70354 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Msx3P70354 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Msx3P70354 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms