Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Stra8P70278 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Stra8P70278 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Stra8P70278 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Stra8P70278 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Stra8P70278 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Stra8P70278 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Stra8P70278 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Stra8P70278 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Stra8P70278 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Stra8P70278 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Stra8P70278 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Stra8P70278 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Stra8P70278 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Stra8P70278 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Stra8P70278 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Stra8P70278 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
Stra8P70278 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Stra8P70278 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Stra8P70278 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Stra8P70278 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Stra8P70278 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Stra8P70278 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Stra8P70278 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Stra8P70278 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Stra8P70278 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Stra8P70278 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Stra8P70278 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Stra8P70278 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Stra8P70278 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Stra8P70278 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Stra8P70278 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Stra8P70278 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Stra8P70278 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Stra8P70278 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Stra8P70278 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Stra8P70278 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Stra8P70278 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Stra8P70278 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Stra8P70278 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Stra8P70278 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Stra8P70278 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Stra8P70278 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Stra8P70278 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Stra8P70278 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Stra8P70278 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Stra8P70278 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Stra8P70278 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Stra8P70278 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Stra8P70278 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Stra8P70278 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Stra8P70278 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Stra8P70278 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Stra8P70278 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Stra8P70278 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Stra8P70278 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Stra8P70278 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Stra8P70278 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Stra8P70278 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Stra8P70278 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Stra8P70278 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Stra8P70278 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Stra8P70278 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Stra8P70278 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Stra8P70278 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Stra8P70278 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Stra8P70278 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Stra8P70278 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Stra8P70278 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Stra8P70278 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Stra8P70278 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Stra8P70278 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Stra8P70278 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Stra8P70278 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Stra8P70278 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Stra8P70278 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Stra8P70278 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Stra8P70278 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Stra8P70278 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Stra8P70278 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Stra8P70278 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Stra8P70278 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Stra8P70278 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Stra8P70278 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Stra8P70278 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Stra8P70278 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Stra8P70278 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Stra8P70278 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Stra8P70278 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Stra8P70278 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Stra8P70278 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Stra8P70278 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Stra8P70278 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Stra8P70278 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Stra8P70278 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Stra8P70278 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Stra8P70278 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Stra8P70278 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Stra8P70278 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Stra8P70278 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms