Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkn1P70268 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms