Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Traf5P70191 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Traf5P70191 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Traf5P70191 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Traf5P70191 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Traf5P70191 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Traf5P70191 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Traf5P70191 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Traf5P70191 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Traf5P70191 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Traf5P70191 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Traf5P70191 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Traf5P70191 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Traf5P70191 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Traf5P70191 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Traf5P70191 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Traf5P70191 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Traf5P70191 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Traf5P70191 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Traf5P70191 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Traf5P70191 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Traf5P70191 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Traf5P70191 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Traf5P70191 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Traf5P70191 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Traf5P70191 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Traf5P70191 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Traf5P70191 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Traf5P70191 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Traf5P70191 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Traf5P70191 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Traf5P70191 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Traf5P70191 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Traf5P70191 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Traf5P70191 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Traf5P70191 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Traf5P70191 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Traf5P70191 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Traf5P70191 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Traf5P70191 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Traf5P70191 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Traf5P70191 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Traf5P70191 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Traf5P70191 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Traf5P70191 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Traf5P70191 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Traf5P70191 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Traf5P70191 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Traf5P70191 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Traf5P70191 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Traf5P70191 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Traf5P70191 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Traf5P70191 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Traf5P70191 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Traf5P70191 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Traf5P70191 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Traf5P70191 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Traf5P70191 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Traf5P70191 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Traf5P70191 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Traf5P70191 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Traf5P70191 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Traf5P70191 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Traf5P70191 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Traf5P70191 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Traf5P70191 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Traf5P70191 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Traf5P70191 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Traf5P70191 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Traf5P70191 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Traf5P70191 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Traf5P70191 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Traf5P70191 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Traf5P70191 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Traf5P70191 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Traf5P70191 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Traf5P70191 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Traf5P70191 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Traf5P70191 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Traf5P70191 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Traf5P70191 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Traf5P70191 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Traf5P70191 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Traf5P70191 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Traf5P70191 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Traf5P70191 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Traf5P70191 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Traf5P70191 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Traf5P70191 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Traf5P70191 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Traf5P70191 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Traf5P70191 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Traf5P70191 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Traf5P70191 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms