Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkcbP68404 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PrkcbP68404 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PrkcbP68404 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkcbP68404 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkcbP68404 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkcbP68404 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkcbP68404 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkcbP68404 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkcbP68404 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkcbP68404 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkcbP68404 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkcbP68404 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkcbP68404 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkcbP68404 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkcbP68404 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkcbP68404 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkcbP68404 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkcbP68404 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkcbP68404 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkcbP68404 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkcbP68404 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkcbP68404 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkcbP68404 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkcbP68404 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkcbP68404 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkcbP68404 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkcbP68404 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkcbP68404 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkcbP68404 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkcbP68404 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkcbP68404 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkcbP68404 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms