Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp3P63024 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms