Protein–RNA interactions for Protein: P62876

Polr2l, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2lP62876 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Polr2lP62876 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Polr2lP62876 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr2lP62876 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr2lP62876 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms