Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gnb1P62874 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms