Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lsm5P62322 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lsm5P62322 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms