Protein–RNA interactions for Protein: P62196

Psmc5, 26S proteasome regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc5P62196 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psmc5P62196 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmc5P62196 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmc5P62196 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmc5P62196 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmc5P62196 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmc5P62196 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmc5P62196 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc5P62196 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc5P62196 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc5P62196 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc5P62196 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc5P62196 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc5P62196 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc5P62196 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc5P62196 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmc5P62196 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmc5P62196 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmc5P62196 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmc5P62196 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc5P62196 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc5P62196 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc5P62196 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc5P62196 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc5P62196 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc5P62196 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmc5P62196 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmc5P62196 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmc5P62196 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmc5P62196 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmc5P62196 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmc5P62196 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmc5P62196 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmc5P62196 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmc5P62196 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmc5P62196 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmc5P62196 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Psmc5P62196 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmc5P62196 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms