Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lmo4P61969 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmo4P61969 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms