Protein–RNA interactions for Protein: P60334

Cdo1, Cysteine dioxygenase type 1, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdo1P60334 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdo1P60334 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdo1P60334 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdo1P60334 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdo1P60334 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdo1P60334 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdo1P60334 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdo1P60334 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdo1P60334 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms