Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcmtd1P59913 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcmtd1P59913 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcmtd1P59913 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcmtd1P59913 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcmtd1P59913 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcmtd1P59913 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcmtd1P59913 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcmtd1P59913 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcmtd1P59913 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcmtd1P59913 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcmtd1P59913 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcmtd1P59913 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcmtd1P59913 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcmtd1P59913 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcmtd1P59913 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcmtd1P59913 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcmtd1P59913 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcmtd1P59913 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcmtd1P59913 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcmtd1P59913 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcmtd1P59913 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcmtd1P59913 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcmtd1P59913 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcmtd1P59913 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcmtd1P59913 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcmtd1P59913 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcmtd1P59913 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcmtd1P59913 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcmtd1P59913 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcmtd1P59913 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcmtd1P59913 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcmtd1P59913 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcmtd1P59913 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcmtd1P59913 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcmtd1P59913 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcmtd1P59913 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pcmtd1P59913 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pcmtd1P59913 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcmtd1P59913 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.5 ms