Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm2P58774 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tpm2P58774 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tpm2P58774 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms